CDD de 3 Ã 5 mois dans cadre du projet ANR NeuroLOG

CDD de 3 à 5 mois dans cadre du projet ANR NeuroLOG (ANR-06-TLOG-024), Paris

De : "Benedicte Batrancourt" benedicte.batrancourt [ à ] chups.jussieu.fr

Nous proposons un CDD de 3 à 5 mois dans cadre du projet ANR NeuroLOG
(ANR-06-TLOG-024).

Le niveau de rémunération correspond à la grille Ingénieur de Recherche.

Ce projet, coordonné par le laboratoire I3S (Université de Nice), vise à mettre en place la gestion et l'accès à des données de neuroimagerie partiellement structurées, hétérogènes et distribuées sur plusieurs sites cliniques. L'architecture développée est testée et évaluée sur des données cliniques concernant différentes pathologies cérébrales : sclérose en plaques, accident vasculaire cérébral (AVC), tumeur cérébrale.

L'U610 et l'U678 IINSERM sont partenaires de ce projet en tant que site d'applications.
Nous disposons au CHU Pitié-Salpêtrière de données cliniques de patients porteurs d'un AVC ou d'une tumeur cérébrale. Ces données sont collectées dans le cadre du projet Centre d'Anatomie Cognitive (CAC). Le CAC a pour objectif le diagnostic (imagerie, examen neurologique, bilan neuropsychologique) et le suivi longitudinal de patients
présentant des séquelles cognitives suite à une lésion cérébrale focale.

La plateforme CAC est installée avec les composants informatiques suivants : LINUX, Apache, MYSQL, PHP, PHPMyAdmin, Java, Matlab. L'accès et l'interrogation de la base de données CAC, dans le contexte du projet NeuroLOG nécessite une connaissance des systèmes de bases de données (MySQL) et des logiciels de développement
informatique (Java, PHP, MySQL, Matlab).

Les résultats attendus à l'issue de ces 3 mois de développement sont :
- Une boïte à outils développée en PHP, MySQL, Java, Matlab, permettant d'effectuer des traitements sur la base de données. Ces scripts seront intégrés à l'interface utilisateur (site Web).
- Une interface utilisateur simple permettant l'affichage des données textes et images (volume DICOM) et le support de création graphique pour les requêtes anatomo-fonctionnelles.
- Un effort sera réalisé pour converger (nom des champs, construction des requêtes) avec les ontologies développées dans le cadre du projet NEUROLOG.


Contact : Bénédicte Batrancourt, U610 INSERM,
benedicte.batrancourt [ à ] chups.jussieu.fr
http://www.u610.ifrns.chups.jussieu.fr/